CS97 [jupyter notebook] 주피터 노트북 커널 추가(ipykernel) 콘다를 통해 가상환경을 생성하였지만, 주피터 노트북의 커널에서는 생성한 가상환경이 확인되지 않는 경우가 있다. 이 경우 다음과 같이 해결할 수 있다. 1. ipykernel 패키지 설치 # ipykernel 설치 $ pip install ipykernel 2. 커널 추가 2. $ python -m ipykernel install --user --name [virtual-env-name] --display-name "[display-name]" 위에서 virtual-env-name의 경우, 실제로 생성하였던 가상환경명을 말하며, display-name의 경우 주피터 노트북 상에서 보여질 커널명을 의미한다. 2022. 9. 3. [Git] 커밋 메세지 수정하기 아래 명령어를 통해 직전 커밋 정보를 열고, vi기반으로 메세지 수정 후 저장하면 된다. git commit --amend 2022. 9. 3. [linux] scp로 파일 다운로드하는 방법 scp를 통해 데이터를 다운로드하기 위해서는 다음과 같은 명령어를 사용하면 된다. scp [USER NAME]@[SOURCE IP]:[SOURCE PATH] [DESTINATION PATH] 2022. 9. 3. [docker] docker 이미지에 openslide 설치하기 python 베이스 이미지에 openslide를 설치하기 위해서는 다음과 같은 도커 파일을 작성하면 된다. Dockerfile FROM python:3.9.6 RUN apt-get update && apt-get install -y openslide-tools python3-openslide RUN pip install numpy pandas scipy tiffile openslide-python 위 도커이미지는 링크에서 pull을 받아 활용할 수도 있다! (레포지토리 깨알 홍보) 또는 아래 명령어를 통해서도 가능하다. docker push jylee030/wsi-preproc:0.2 여담 : python library만 설치해서는 구동되지 않고 아래와 같은 에러가 발생했었다. Traceback (mos.. 2022. 8. 31. [Python] pyvips 모듈 임포트 오류 (OSError, ModuleNotFoundError) pyvips 라이브러리 사용 시 아래와 같은 오류를 마주할 수 있다. --------------------------------------------------------------------------- ModuleNotFoundError Traceback (most recent call last) ~/anaconda3/envs/[ENV-NAME]/lib/python3.8/site-packages/pyvips/__init__.py in 18 try: ---> 19 import _libvips 20 ModuleNotFoundError: No module named '_libvips' During handling of the above exception, another exception occurred: .. 2022. 8. 22. [jupyter, ipykernel] jupyter kernel 추가가 안될 때 jupyter notebook에 ipykernel을 통해 kernel 을 추가하였지만, 원활하게 실행되지 않는 경우가 있음. 아래 방법을 통해 해결함 1. 위 명령어를 통해 경로를 확인함 $ jupyter kernelspec list Available kernels: py3.9 [경로] 2. 아래 명령어를 통해 경로로 이동 및 경로 변경 $ cd [경로] $ ls kernel.json logo-32x32.png logo-64x64.png 3. vi를 통해 kernel.json의 경로 편집 기존 파일 { "argv": [ "/home/[사용자명]/anaconda3/envs/[JUPYTER-ENV]/bin/python", "-m", "ipykernel_launcher", "-f", "{connection_f.. 2022. 5. 18. 이전 1 ··· 13 14 15 16 17 다음